2014年6月，中国科学院合肥物质科学研究院与合肥市人民政府合作共建成立中科合肥技术创新工程院和科学岛合肥技术创新工程院有限公司。采用“一院一公司”模式（事业单位负责前端研发对接、国企负责成果转化后端服务），以企业化运作推动科技成果落地，助力创业带动就业，两大主体共同肩负“科创+产业”企业培育使命。合肥创新院聚焦数字经济和生命健康领域，在智能网联新能源汽车、数字乡村、低空经济、精准肿瘤医疗等方向重点布局、持续发力，构建产业链创新链协同发展的“创新院模式”，持续赋能安徽经济和科创事业高质量发展。

合肥创新院自有园区占地约91亩，总建筑面积约15万平米，集合众创空间、孵化器、加速器、产业关键技术研发平台、公共技术服务平台于一体。截至目前，合肥创新院先后获得国家级科技企业孵化器、国家级众创空间、国家双创示范基地双创服务平台、国家技术转移示范机构、中国产学研合作促进奖、中国管理科学奖、中国企业改革发展优秀成果一等奖、全国企业管理现代化创新成果二等奖等国家各类荣誉资质。合肥创新院园区已累计孵化89家国家高新技术企业，9家国家专精特新小巨人企业，积聚研发人员超过2000人，累计实现产值超75亿元，税收超3亿元。培育出中科中涣、中科海奥两家上市辅导期企业，中科普瑞昇、中科光博、中科智驰等上市培育期企业。